Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp54Q8BL06 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp54Q8BL06 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp54Q8BL06 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp54Q8BL06 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp54Q8BL06 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms