Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Actr5Q80US4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms