Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Clec18aQ7TSQ1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Clec18aQ7TSQ1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Clec18aQ7TSQ1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clec18aQ7TSQ1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Clec18aQ7TSQ1 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 544.6 ms