Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Xrcc1Q60596 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc1Q60596 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc1Q60596 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc1Q60596 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc1Q60596 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc1Q60596 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Xrcc1Q60596 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Xrcc1Q60596 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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