Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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