Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Skap2Q3UND0 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Skap2Q3UND0 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms