Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 CU025215.1-201ENSMUST00000222986 603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Edc4Q3UJB9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Edc4Q3UJB9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms