Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms