Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43593-201ENSMUST00000198605 1346 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms