Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nf1Q04690 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms