Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gja5Q01231 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms