Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Mesp1P97309 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms