Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Irx1P81068 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms