Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cdca2-205ENSMUST00000150006 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Adal-202ENSMUST00000066155 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Slco1b2-204ENSMUST00000203597 1965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ptk2-209ENSMUST00000226988 4444 ntAPPRIS ALT1 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Lysmd4-204ENSMUST00000207823 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Mpp1-201ENSMUST00000033775 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Cd200-202ENSMUST00000163230 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Nrf1-205ENSMUST00000115200 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Gm43119-201ENSMUST00000196957 2122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irx2P81066 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms