Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Otx2P80206 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx2P80206 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Otx2P80206 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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