Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SbdsP70122 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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