Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms