Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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