Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pde6aP27664 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pde6aP27664 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pde6aP27664 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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