Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd12P23812 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms