Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RarbP22605 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RarbP22605 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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