Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TP20293 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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TP20293 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TP20293 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TP20293 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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