Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Vpreb2P13373 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb2P13373 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms