Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01679 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01679 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01679 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms