Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm2035J3QP87 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm2035J3QP87 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm2035J3QP87 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm2035J3QP87 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm2035J3QP87 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2035J3QP87 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm2035J3QP87 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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