Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zc3h10-201ENSMUST00000040572 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Fam186b-201ENSMUST00000109100 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm45705-201ENSMUST00000211831 2134 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Smim18J3QNP2 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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