Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp72F8VQC1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms