Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ScaperF8VQ70 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms