Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21876F6XK35 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms