Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm17555F6U8B9 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm17555F6U8B9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm17555F6U8B9 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm17555F6U8B9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms