Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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