Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms