Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rabgef1Q9JM13 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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