Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
OtofQ9ESF1 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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