Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 1700030L20Rik-201ENSMUST00000189233 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC123935.1-201ENSMUST00000225588 409 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Xcl1-201ENSMUST00000027860 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Riok3Q9DBU3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms