Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Med27Q9DB40 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms