Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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