Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms