Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Khdc3Q9CWU5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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