Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms