Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Bhlhe41Q99PV5 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms