Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp1b4Q99ME6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp1b4Q99ME6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms