Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp16Q99LG0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp16Q99LG0 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp16Q99LG0 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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