Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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