Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ubxn4Q8VCH8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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