Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2afjQ8R1M2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2afjQ8R1M2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms