Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf428Q8C1M2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms