Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp54Q8BL06 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp54Q8BL06 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms