Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Q8BGC1 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q8BGC1 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q8BGC1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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