Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Clec18aQ7TSQ1 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Clec18aQ7TSQ1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Clec18aQ7TSQ1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Clec18aQ7TSQ1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms